ارزیابی روش‌های مختلف استخراج DNA از ماهیان قزل‌آلای‌رنگین‌کمان طلایی پرورشی (Golden Rainbow Trout: Oncorhynchus mykiss) به منظور مطالعه مولکولی

Authors

  • اکبرنژاد, بهاره
  • زارع کاریزی, شهره
  • یوسفی سیاه کلرودی, سیامک
Abstract:

استخراج DNA یک گام معمول در بسیاری از مطالعات بیولوژیکی است و روش­های مختلفی جهت جداسازی مولکول DNA از مواد بیولوژیکی ابداع شده است. بسیاری از این روش­ها دارای سه هدف: 1- لیز سلول و خروج اسید­نوکلئیک از مایع درون سلولی، 2- از بین بردن مولکول­های آلی و معدنی غیر از اسید­نوکلئیک در مایع درون سلولی و 3- به حداقل رساندن تخریب اسید­نوکلئیک­ها در طی مراحل خالص­سازی می­باشند. ماهی قزل­آلای­رنگین­کمان از جمله گونه­های اهلی شده آزاد ماهیان بوده و امروزه مهم­ترین گونه ماهی سردآبی در کشور است. جهت انجام این پژوهش 4 روش استخراج: 1- کیت استخراج شرکت Gena All،  2- Trizol Reagent، 3- روش سنتی حرارت و آنزیم پروتئیناز­K و 4- فنل­کلروفرم مورد بررسی قرار گرفت و مشخص شد که بهترین روش استخراج از لحاظ کیفیت و کمیت DNA استخراج شده توسط دستگاه نانودراپ و ژل آگاروز 1 در­صد و همچنین از لحاظ کارآمد بودن PCR مربوط به روش کیت استخراج DNA شرکت Gene All کشور کره جنوبی می­باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

چندشکلی ژن تیروزیناز در ماهیان قزل‌آلای‌رنگین‌کمان طلایی پرورشی (Golden Rainbow Trout: Oncorhynchus mykiss)

به­منظور بررسی چندشکلی ژن تیروزیناز در ماهیان قزل­آلای رنگین­کمان طلایی، استحراج DNA از باله دمی 100 قطعه بچه­ماهی انجام گرفتت. تکثیر ناحیه پلی­مورفیک bp423 ژن تیروزیناز  با استفاده از تکنیک PCR و پرایمر­های اختصاصی Tyr1.2r و Tyr1.2f انجام شد. سپس به­منظور هضم آنزیمی از آنزیم برشگر Hinf1 استفاده شد. بر ­این اساس سه الگوی برشی مشاهده شدند که در حالت اول افراد دارای دو قطعه bp222 و bp201، دارای ژ...

full text

Rainbow Trout, Oncorhynchus mykiss

Rainbow trout are classified as Oncorhynchus mykiss, and as such belong to the same genus as Pacific salmon, and to the family Salmonidae, which includes Atlantic salmon (Salmo salar), various trout (Salvelinus sp.), Arctic char (Salvelinus alpinus), Arctic grayling (Thymallus arcticus) and whitefish (Coregonus sp.). Rainbow trout are native to areas around the North Pacific Ocean, from souther...

full text

Immersion vaccination of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) against Flavobacterium psychrophilum

Flavobacterium psychrophilum is the causal agent of rainbow trout fry syndrome (RTFS), which seriously affects rainbow trout aquaculture. The disease affects fish at early life stage and can cause high mortality. Within trout aquaculture several procedures have been implemented in order to reduce the disease problem. Use of ”Flavo free” broodstock and disinfection of eggs can reduce probability...

full text

Serotonin-induced brain glycogenolysis in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss).

In this study, we evaluated the serotonin-mediated control of cerebral glycogen levels in the rainbow trout, Oncorhynchus mykiss. Intracerebroventricular (i.c.v.) administration of serotonin (5-HT) to normoglycemic trout (time and dose response) decreased glycogen levels in the brain and increased brain glycogen phosphorylase activity (time response). In hypoglycemic fish (that had been fasted ...

full text

Hydrogen sulfide stimulates catecholamine secretion in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss).

We tested the hypothesis that endogenously produced hydrogen sulfide (H(2)S) can potentially contribute to the adrenergic stress response in rainbow trout by initiating catecholamine secretion from chromaffin cells. During acute hypoxia (water Po(2) = 35 mmHg), plasma H(2)S levels were significantly elevated concurrently with a rise in circulating catecholamine concentrations. Tissues enriched ...

full text

Creatine metabolism differs between mammals and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Creatine plays an important role in the cell as an energy buffer. As the energy system is a basic element of the organism it may possibly contribute to differences between rainbow trout strains selected for the traits growth and robustness, respectively. The cDNA sequences of creatine-related genes encoding glycine amidinotransferase (GATM), guanidinoacetate N-methyltransferase (GAMT), creatine...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 12  issue 2

pages  1- 11

publication date 2018-05

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023